Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms