Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLASP1Q7Z460 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLASP1Q7Z460 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLASP1Q7Z460 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLASP1Q7Z460 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLASP1Q7Z460 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLASP1Q7Z460 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CLASP1Q7Z460 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLASP1Q7Z460 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms