Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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USP53Q70EK8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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