Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms