Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL17Q6UXB2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms