Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRIP1Q5VSL9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms