Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms