Protein–RNA interactions for Protein: Q49SQ1

GPR33, Probable G-protein coupled receptor 33, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR33Q49SQ1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPR33Q49SQ1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms