Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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