Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PUM3Q15397 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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