Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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PTPRKQ15262 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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