Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms