Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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