Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TROQ12816 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TROQ12816 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TROQ12816 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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