Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRA2BP62995 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms