Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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