Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME5P56597 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms