Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF143P52747 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF143P52747 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF143P52747 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF143P52747 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF143P52747 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms