Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms