Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHCGRP22888 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms