Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms