Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF3P18847 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF3P18847 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms