Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms