Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms