Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms