Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms