Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms