Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC169A6NNP5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms