Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWA8A3KMH1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms