Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A1W2PPC4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms