Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms