Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms