Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIRT3Q9NTG7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms