Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCC2Q9HCC0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms