Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms