Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms