Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms