Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms