Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAVIN3Q969G5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms