Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP4Q8N2S1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms