Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms