Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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