Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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