Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms