Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM29Q14134 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms