Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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