Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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