Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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MKRN4PQ13434 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TCEAL1-202ENST00000372625 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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