Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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