Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TRAF2Q12933 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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